BMJcasereports[IF:N/A]
①65岁女性,长期规律服用格列齐特等药物,每天至少喝一瓶Actimel酸奶(达能出品,含干酪乳杆菌干酪亚种CNCMI-株);②确诊严重肝脓肿和菌血症,采用超声引导下穿刺引流和广谱抗生素,但败血症持续,并发右侧胸腔积液、下腔静脉血栓、感染性肺栓塞;③利用血琼脂平板,在病人样本中培养出与酸奶中一致的干酪乳杆菌菌株,并经多种实验方法确定;④这首次明确特定“益生菌”可能造成肝脓肿,研究者提醒免疫功能低下人群应慎重摄入活菌。
Lactobacillus:thenotsofriendlybacteria
-09-13DOI:10./bcr--
NEJM:如何应对食物过敏?TheNewEnglandJournalofMedicine[IF:72.]
①花生是最常见的食物过敏源,食物过敏有多个危险因素,全身性过敏反应的诊断有三类标准;②获取相应的病史、与过敏性疾病专家一起解读临床检查结果对食物过敏的诊断和治疗至关重要;③目前的治疗手段包括:识别全身性过敏反应的症状和体征、肾上腺素自动注射、注射后在急诊室内立即评估监测、严格避免接触食物过敏源、进行食物安全教育;④生命早期摄入花生,可显著减少花生过敏的风险,多种免疫治疗的临床研究正在进行。
FoodAllergy
-09-21DOI:10./NEJMcp
Nature子刊:直接从宏基因组识别病毒序列NatureProtocols[IF:10.]
①在对大型微生物数据集的分析中,易感染菌群的病毒是遗传多样性的主要来源,对生物地球化学循环和生物体健康有很大的影响;②提出了一个从微生物组中直接检测相关病毒的方案,对来自微生物样本的病毒序列进行准确检测和分组;③使用一组病毒蛋白家族作为诱饵,直接从宏基因组识别病毒序列;④具体介绍了:如何使用病毒蛋白家族目录,如何选择过滤器以检测宏基因组样品中的病毒重叠群,以及如何将病毒序列组织成准物种分类级别的具体参数。
Nontargetedvirussequencediscoverypipelineandvirusclusteringformetagenomicdata
-08-01DOI:10./nprot..
Microbiome:用于分析16SrRNA基因测序结果的流水线方法Microbiome[IF:8.]
①使用通用PCR引物对原核生物特异性的16SrRNA基因的测序可研究菌群组成,标准化方案有助于可重复分析;②短读库16SrRNA基因测序流水线(sl1p)可将预先存在的工具组合生成计算方法,自动处理原始的16SrRNA基因测序数据,转换成可读的表格和图形;③使用八个OTU聚类算法、两个分类方法和三个16SrRNA基因参考数据库来比较模拟群落生成的数据,④结果表明sl1p可通过提供全面的日志文件来促进可重复的研究,并减少用户处理测序数据的难度。